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Plateforme & installation | Génomique

Plateforme ARN interférence

Services, Ressources, Références


​Soutien financier CNRS, CEA, InCa, ANR, IBisa, Ligue Nationale contre le Cancer, Réseau National des Génopoles, ARC, AFM.

Publié le 30 juillet 2018

​Services proposés

Mise au point, développement et optimisation de tests cellulaires miniaturisés (96 et 384 puits)
Criblages cellulaires à haut débit ou a haut contenu (cribles directs, modificateurs, différentiels, combinatoires, STarS assay…)
Analyses biostatistiques de données de grandes dimensions
Analyses bioinformatiques (biologie des systèmes, analyse des réseaux de gènes et des voies de signalisation, modélisations mathématiques…)

Les projets de criblage exécutés sur la plateforme PARi peuvent être mis en œuvre sur une base collaborative, ou sous la forme d’une prestation de service. Les couts font l’objet d’une estimation précise évaluée au cas par cas, essentiellement fonction de la complexité du modèle cellulaire, de la nature et de la dimension du crible.

 

Ressources

Banques ARN interférentes:
-Banque siARN pangénomique humaine (23000 gènes, 4 siARNs individuels/gène, Qiagen)
-Banque siARN « On-Target Plus » pangénomique humaine (18000 gènes, Pool de 4 siARNs/gène, Thermo)
-Banque LNA (inhibiteurs des miARNs) pangénomique humaine (994 LNAs, 1 LNA/miARN, miRBase V19, Exiqon)
-Banque de surexpression des miARNs humains (2050 « mimiques », 1 « mimique »/miARN, miRBase V19, Thermo).
-Banque d’inhibiteurs des miARNs humains (2050 inhibiteurs, 1 hairpin/miARN, miRBase V19, Thermo)

Automates pipeteurs diluteurs à 8 et 96 canaux (Microlab Star & Nimbus, Hamilton) installés sous hottes à flux laminaires.
Microscope à épifluorescence et confocal à haut débit (Operetta, Perkin-Elmer).
Lecteur de microplaques multimode (Fluo/Lumino/Spectro) avec injecteurs (Mithras LB940, Berthold)
Dispenseur fluidique (Multidrop combi, Thermo) et laveur de plaques (Elx-405, Biotek)
Compteur de cellules (Z1, Beckman-Coulter)

 

 

Références

Projets collaboratifs et prestations déjà réalisés avec :
 
Jacques BERTOGLIO, Inserm U749, Châtenay-Malabry, France
Jean-Yves BLAY, Inserm U590, Lyon, France
Jacques CAMONIS, Inserm U830, Institut Curie, Paris, France
Michel COGNE, UMR CNRS 6101, Limoges, France
Xavier GIDROL, CEA/IRTSV/Biomics, Grenoble, France
Christophe GINESTIER, INSERM U891, Marseille, France
Guido KROEMER, Inserm U848, Institut Gustave Roussy, Villejuif, France 
Carl MANN, CEA, Saclay, France
Dominique MAZIER, Inserm U511, Paris, France
Christian MUCHARDT, Institut Pasteur URA 2578, Paris, France
Olivier NEYROLLES, Institut Pasteur, Seoul, Corée
Marc PESCHANSKI, ISTEM, Evry, France
Pablo RADICELLA, CEA, Fontenay-Aux-Roses, France
Jean-Ehrland RICCI, INSERM U895, Nice, France