Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot - Sur le même thème https://joliot.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/les-fantomes-de-la-fluorescence.aspx Site web de l'Institut des sciences du vivant Frédéric-Joliot qui comprend 4 départements : l'I2BC, le DMTS, NeuroSpin et le Service hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ). Les équipes sont localisées principalement sur le centre CEA Paris-Saclay et à l'hôpital d'Orsay. fr-FR https://www.cea.fr/Style%20Library/Themes/drf/instituts/images/logo-cea-joliot-2023.png Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot - Sur le même thème https://joliot.cea.fr/drf/joliot Epigénétique : combiner des régions flexibles et rigides dans une seule structure pour garantir la réplication et la stabilité du génome https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2024/Epigenetique-CAF-1.aspx Une équipe de l’I2BC en collaboration avec l’Institut Curie et Soleil, montre que la protéine CAF-1 combine dans son organisation spatiale des régions flexibles et des modules rigides pour déposer les histones sur l’ADN et coupler efficacement ce processus à la synthèse d’ADN. Epigénétique ; Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique ; Article Tue, 26 Mar 2024 11:00:00 GMT Cryo-EM : Une organisation en anneau pour mieux contrôler la concentration locale de BRCA2 indispensable à la recombinaison homologue https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2024/Cryo-EM-anneau-BRCA2-HSF2BP.aspx Une collaboration impliquant l’I2BC a modélisé la structure du complexe entre HSF2BP et un fragment de BRCA2, indispensable à la réparation de l’ADN par recombinaison homologue. Les chercheurs proposent un mécanisme de régulation de l’assemblage inattendu en anneau de ce complexe. Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique ; Article Thu, 08 Feb 2024 11:00:00 GMT Interactions protéines-protéines : comment repousser les limites du révolutionnaire programme AlphaFold2 ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2024/Interactions-proteines-proteines-AlphaFold2.aspx Dans un article publié dans Nature Communications, des chercheurs de l’I2BC montrent qu’appliquer une stratégie de fragmentation des partenaires protéiques d'assemblages dépendant de régions intrinsèquement désordonnées améliore très significativement la capacité d’AlphaFold2. à prédire la structure des sites d'interaction. ​ Biologie structurale ; Intelligence artificielle Chercheurs SB2SM Résultat scientifique Mon, 29 Jan 2024 11:00:00 GMT L’acide phytique : une petite molécule qui aide à réparer les cassures de l’ADN https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/acide-phytique-petite-molecule-aide-reparation-ADN.aspx Dans un article publié dans la revue Nucleic Acids Research, des scientifiques de l'I2BC, de l'lPBS et de l'Institute for Structural and Chemical Biology (University of Leicester, UK) démontrent comment l’acide phytique, un produit du métabolisme cellulaire, stabilise l’assemblage d’un complexe permettant la réparation des cassures de l’ADN chez l’Homme. ADN ; Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique ; Article Mon, 04 Dec 2023 11:00:00 GMT Décryptage des microbiotes : l’identification d’isolats microbiens fortement accélérée par protéotypage multiplex https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Identification-isolats-microbiens-par-proteotypage-multiplex.aspx Des chercheurs du SPI proposent une méthode innovante de multiplexage pour l’identification rapide de plusieurs isolats microbiens en une seule analyse de spectrométrie de masse. Une approche qui ouvre des perspectives d’identification à grande échelle des microorganismes issus de programmes de culturomique. Biologie à grande échelle ; Méthodologies pour les sciences du vivant ; Protéomique ; Bactéries SPI Résultat scientifique Fri, 24 Nov 2023 11:00:00 GMT Le voile se lève sur les secrets de la reproduction végétale https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/2023/les-secrets-de-la-reproduction-vegetale.aspx Des scientifiques d’INRAE et du CEA ont fait un pas de géant pour lever le voile sur la reproduction végétale, en identifiant des protéines essentielles pour la création de nouvelles variétés de plantes. Leurs résultats sont parus le 16 octobre dans la revue Nature Plants. Santé & sciences du vivant ; Biologie structurale Journalistes ; Chercheurs ; Grand public ; Enseignants SB2SM Communiqué de presse inrae;complexe synaptonémal;Information génétique;DRF;chromosome;végétation;découverte;génétique;publication scientifique;méiose;science du vivant; Thu, 16 Nov 2023 11:00:00 GMT Multiplier les chimères pour mieux comprendre les interactions inhibiteur-cible protéique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Multiplier-chimeres-mieux-comprendre-interactions-inhibiteur-cible-proteique.aspx En substituant des segments d’hélice alpha​ par des segments d’oligo-urées dans un peptide inhibiteur d’ASF1, lui conférant ainsi une résistance accrue aux protéases, des chercheurs de l’I2BC en collaboration avec l’IECB explorent les modes de liaison de ces chimères peptide-urée à leur cible. Mécanismes moléculaires ; Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique ; Article Tue, 12 Sep 2023 10:00:00 GMT Déficit en transporteur de la créatine : utilisation de deux modèles originaux pour cerner cette maladie génétique rare https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Proteines-impliquees-pathogenese-deficit-transporteur-creatine.aspx Des chercheurs du SPI/DMTS ont identifié par spectrométrie de masse des biomarqueurs liés au trouble du déficit en transporteur de la créatine (CTD) en utilisant 2 modèles originaux: des souris présentant les caractéristiques cliniques de sujets atteints de CTD et des organoïdes cérébraux dérivés de cellules de patients-CTD Spectrométrie de masse ; Maladies génétiques ; Biomarqueurs ; Protéomique SPI Résultat scientifique Thu, 22 Jun 2023 10:00:00 GMT La machinerie de la réparation de l’ADN plus flexible grâce à PAXX ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Reparation-ADN-PAXX.aspx Une collaboration internationale co-dirigée par des chercheurs de l'institut CEA-Joliot décrit à l'échelle atomique une variété d’assemblages moléculaires, contenant tous la protéine PAXX, impliqués dans la réparation des cassures double-brin de l’ADN. Cette flexibilité de la machinerie de la réparation pourrait traduire sa capacité à s’adapter à la nature des cassures. Biologie structurale ; Mécanismes moléculaires Chercheurs SB2SM Résultat scientifique cryoEM;radiocristallographie; Tue, 06 Jun 2023 10:00:00 GMT Peut-on conditionner les protéines dans du plastique ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/biotherapies-peut-on-conditionner-les-proteines-dans-du-plastique.aspx Selon une étude menée par les instituts Iramis et Joliot avec leurs partenaires, des protéines en solution peuvent être déstabilisées au contact des parois d'un flacon en plastique, puis former des agrégats protéiques dégradés. Un point d'attention pour le conditionnement des protéines thérapeutiques. Diagnostic et thérapies innovantes ; Mécanismes moléculaires ; Protéomique Chercheurs ; Grand public ; Journalistes Joliot Découvertes et avancées ; Résultat scientifique Wed, 22 Mar 2023 11:00:00 GMT Identification rapide et à grande échelle du microbiote pulmonaire de la mucoviscidose par métaprotéomique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Identification-microbiote-pulmonaire-mucoviscidose-metaproteomique.aspx Une équipe du Li2D a utilisé la spectrométrie de masse en tandem pour identifier les micro-organismes présents dans des échantillons d’expectoration de patients atteints de mucoviscidose. Une approche prometteuse de protéotypage qui apporte une vue élargie et non biaisée du microbiote et pourrait être complémentaire de la surveillance microbiologique des patients. Biologie à grande échelle ; Méthodologies pour les sciences du vivant ; Protéomique SPI Résultat scientifique Tue, 14 Feb 2023 11:00:00 GMT D’une toxine marine à un antagoniste du récepteur de la mélanocortine, cible thérapeutique des troubles du métabolisme énergétique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Toxine-cone-marin-antagoniste-recepteur-melanocortine.aspx Une équipe du SIMoS découvre, dans le venin d’un cône marin, une toxine qu’elle dérive par ingénierie en un peptide antagoniste à forte affinité pour le récepteur de la mélanocortine, régulateur majeur de l’homéostasie énergétique. Un pas vers le développement de traitements inédits de certains troubles de l’alimentation. Santé & sciences du vivant ; Pharmacologie ; Criblage haut débit ; Protéomique ; Transcriptomique SIMOPRO Résultat scientifique Thu, 09 Feb 2023 11:00:00 GMT Virus de l’hépatite E : AlphaFold à la rescousse pour mieux comprendre comment ce pathogène multiplie son génome https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Virus-hepatite-E-AlphaFold.aspx Des chercheurs de l’I2BC dévoilent un modèle atomique de la polyprotéine de réplication du virus de l’hépatite E obtenu grâce au programme d’intelligence artificielle AlphaFold. Le modèle permet de mieux comprendre comment ce virus à ARN multiplie son génome dans les cellules infectées. Biologie structurale ; Simulation & modélisation ; Intelligence artificielle Chercheurs SB2SM Résultat scientifique traduction in vitro;virusà ARN;AlphaFold2; Wed, 08 Feb 2023 11:00:00 GMT La simulation numérique renseigne sur la restriction de la dynamique de la protéine BAF par la phosphorylation https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/BAF-simulation-numerique-dynamique-phosphorylation.aspx Grâce à la simulation de dynamique moléculaire et des études RMN, des chercheurs de l’I2BC détaillent la mécanique de restriction de la dynamique de la protéine BAF due à sa phosphorylation. Mécanismes moléculaires ; Biologie structurale ; Simulation & modélisation Chercheurs SB2SM Résultat scientifique Mon, 16 Jan 2023 11:00:00 GMT Vers la compréhension des mécanismes responsables de la cholestase intrahépatique : étude biochimique et structurale de l’ATPase humaine ATP8B1 https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Cholestase-intrahepatique-biochimie-structure-ATP8B1.aspx ​Une étude impliquant une équipe de l’I2BC dévoile le mécanisme d’autoinhibition de la flippase humaine ATP8B1, ainsi que sa régulation par les lipides et la phosphorylation. L’étude permet de mieux comprendre l’impact des mutations de la flippase responsables de cholestases intrahépatiques sur son activité. Mécanismes moléculaires ; Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique ATP;hydrolyse;protéine membranaire;modifications post-traductionnelles;expression hétérologue;membranes;cryo-EM; Thu, 09 Jun 2022 10:00:00 GMT Le LI2D et la startup Phylogene s’associent pour améliorer l’analyse des microbiotes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/LI2D-Phylogene-DeepMicro.aspx Le LI2D s’est récemment associé à la société Phylogene (Nîmes), au travers du projet DeepMicro qui vise à développer de nouvelles techniques d’analyses, plus puissantes. L’acquisition d’un spectromètre de masse à très haute résolution, grâce au soutien financier de la Région Occitanie, constitue une étape décisive dans la mise en œuvre du projet. Le CEA et Phylogene ont publié un communiqué de presse le 10 mai. Protéomique Entreprises ; Institutionnels ; Journalistes ; Grand public Marcoule Communiqué de presse spectrométrie de masse;microbiome; Fri, 13 May 2022 10:00:00 GMT Un possible lien entre des modifications du microbiote intestinal et la charge fécale en SARS-CoV-2 ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Lien-microbiote-intestinal-Covid-19.aspx Une équipe du SPI (DMTS, Marcoule) a utilisé la spectrométrie de masse pour analyser le degré d’altération du microbiote intestinal de patients Covid-19 et pour rechercher des signatures de l’infection intestinale par le virus SARS-CoV-2. La dysbiose observée chez ces patients pourrait être un indicateur du stade et de l'importance de l'infection. Spectrométrie de masse ; Protéomique ; Biomarqueurs ; Maladies infectieuses SPI Résultat scientifique ; Article Thu, 12 May 2022 10:00:00 GMT La structure atomique des nanotubes de lanréotide dévoilée surprend ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/structure-nanotubes-lanreotide.aspx Grâce aux développements récents de la cryomicroscopie électronique, une étude dirigée par une équipe de l’I2BC révèle, à l’échelle atomique, la complexité structurale insoupçonnée des nanotubes de lanréotide, médicament utilisé dans le traitement de l’acromégalie et de certains cancers neuro-endocriniens. Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique Thu, 20 Jan 2022 11:00:00 GMT La modélisation in silico lève le voile sur l’union appariement/recombinaison homologue durant la méiose https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Modelisation-union-appariement-recombinaison-meiose.aspx Dans une étude menée par une équipe de l’Institut Curie, des chercheurs du CEA-Joliot (département B3S/I2BC) ont modélisé in silico des interactions protéines-protéines et ainsi contribué à établir au niveau moléculaire les mécanismes qui coordonnent l’appariement et la recombinaison des chromosomes homologues durant la méiose. Simulation & modélisation ; Biologie structurale ; Mécanismes moléculaires Article ; Résultat scientifique recombinaison homologue;AlphaFold;crossing-over;InterEvDock3; Thu, 13 Jan 2022 11:00:00 GMT La métaprotéomique et la science des données pour un diagnostic d’éco-santé du microbiote des sols https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Metaproteomique-science-donnees-microbiote-sols.aspx Des chercheurs du Li2D (SPI/DMTS, Marcoule) et du LSCE ont développé une méthodologie innovante d’analyse du microbiote des sols reposant sur une interprétation informatique optimale des bases de données de métaprotéomique qui devrait notamment permettre de mieux comprendre l’impact des polluants sur la qualité des sols et de prédire leur potentiel de restauration. Environnement ; Protéomique ; Spectrométrie de masse ; Bactéries LSCE Résultat scientifique Thu, 07 Oct 2021 10:00:00 GMT Le projet européen PPI4HPC se fait l’écho du calcul haute performance au CEA pour la modélisation d’assemblages moléculaires complexes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/chercheurs-media/Calcul-haute-performance-CEA-modelisation-moleculaire.aspx Un projet à l’interface chimie quantique et dynamique moléculaire pour l’étude d’assemblages moléculaires complexes, porté par Michel Masella (Joliot) et Luigi Genovese (IRIG), permet, pour des applications en biologie/santé, de tirer pleinement profit des nouveaux supercalculateurs du projet Public Procurement of Innovations for High Performance Computing (PPI4HPC, H2020) hébergés au Très Grand Centre de Calcul (TGCC) du CEA-Bruyères-le-Châtel. Calcul haute performance ; Supercalculateurs ; Simulation & modélisation ; Biologie structurale Actualité ; Article Tue, 14 Sep 2021 10:00:00 GMT Structure du complexe BRCA2-HFS2BP : l’interaction n’est pas nécessaire au recrutement de Rad51 sur l’ADN en méiose https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/BRCA2-HFS2BP-meiose.aspx ​En résolvant la structure tridimensionnelle d’un fragment du complexe BRCA2-HSF2BP, une collaboration impliquant des équipes de l’I2BC et de l’ERASMUS MC identifie le motif précis de BRCA2 à l’origine de la très forte affinité entre les deux partenaires et montre que, in vivo, ce complexe n’a pas de fonction dans le recrutement de Rad51 aux sites méiotiques de recombinaison homologue. Biologie structurale Chercheurs SB2SM Article ; Résultat scientifique RMN;radiocristallographie; Mon, 13 Sep 2021 10:00:00 GMT 3e version du serveur InterEvDock : mieux exploiter les données d’évolution des séquences protéiques pour améliorer la prédiction des structures d’interfaces https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/InterEvDock3.aspx Des chercheurs de l’I2BC/CEA-Joliot, en collaboration avec la plateforme RPBS, ont développé la 3e version de leur serveur InterEvDock pour la modélisation structurale des interactions protéines-protéines, avec de nouveaux algorithmes pour exploiter les informations sur l’évolution des séquences. Des performances améliorées ! Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique HADDOCK;FRODOCK;CAPRI;coMSAs; Mon, 21 Jun 2021 10:00:00 GMT Bases moléculaires du mécanisme de ciseaux moléculaires impliqués dans la recombinaison méiotique et dans la réparation de l’ADN https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Mlh1-Mlh3.aspx Des chercheurs de l’I2BC/CEA-Joliot en collaboration avec une équipe de l’institut Curie et de l’IRCM/CEA-Jacob, posent les bases moléculaires pour expliquer le double rôle du complexe Mlh1-Mlh3 dans la réparation des mésappariements d’ADN et, fait unique, dans l’une des étapes clefs du brassage génétique lors de la méiose. Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique cristallographie;réparation;recombinaison; Mon, 07 Jun 2021 10:00:00 GMT Biologie structurale : Un MOOC, un book et vice et versa https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2021/MOOC-bio-cristallo-livre.aspx Marie-Hélène Le Du (équipe du LBSR/I2BC/CEA-Joliot) et plusieurs membres de l'équipe à l'initiative du MOOC " Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie " viennent de publier "Introduction à la cristallographie biologique" aux éditions EDPSciences. Un beau prolongement du travail pédagogique initial... ou un point de départ idéal pour explorer le MOOC. Au choix. Biologie structurale Article structure;cristallographie;protéine; Fri, 28 May 2021 10:00:00 GMT La phosphorylation de BAF altère sa dynamique et son interaction avec l’ADN mais pas ses contacts avec l’enveloppe nucléaire https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/phosphorylation-BAF-interaction.aspx ​Une étude menée par des chercheurs de l'I2BC dévoile in vitro l'effet de la phosphorylation mitotique de la protéine BAF sur sa structure et ses interactions avec l'ADN et la lamina et ses conséquences possibles sur l’organisation du génome et sur les mécanismes responsables de syndromes progéroïdes. Mécanismes moléculaires ; ADN ; Biologie structurale Chercheurs SB2SM Résultat scientifique RMN;radiocristallographie; Mon, 29 Mar 2021 10:00:00 GMT Stratégie thérapeutique anticancéreuse : une chimère pour inhiber ASF1 https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Chimere-inhibiteur-ASF1.aspx Des chercheurs de l’I2BC, en collaboration avec l’IECB ont développé une molécule chimérique de type peptide/foldamère, résistante à la protéolyse et inhibitrice d’ASF1, cible potentielle de traitement anticancéreux. La résolution de la structure de la chimère en interaction avec sa cible, première du genre, met en évidence une plasticité insoupçonnée de son squelette à base d’urée. Biologie structurale ; Mécanismes moléculaires ; Epigénétique ; Cancer Chercheurs SB2SM Résultat scientifique cristallographie;RMN; Fri, 19 Mar 2021 11:00:00 GMT Première caractérisation fonctionnelle d’ATP2, flippase essentielle du Plasmodium et cible antipaludéenne potentielle https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Caracterisation-fonctionnelle-PcATP2-flippase-Plasmodium.aspx Des chercheurs de l’I2BC, en collaboration avec l’université autonome de Barcelone, ont mis en évidence, pour la première fois, la fonction et l’organisation structurelle d’une flippase exprimée chez le parasite responsable du paludisme, un pas décisif vers la compréhension de la fonction physiologique essentielle de ce transporteur et de son utilisation potentielle comme cible antipaludique. Maladies infectieuses ; Biologie structurale SB2SM Résultat scientifique Wed, 17 Mar 2021 11:00:00 GMT Couronne protéique autour des nanoparticules : une affaire de taille ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/couronne-proteique-autour-des-nanoparticules--une-affaire-de-taille-.aspx Plongées dans des milieux biologiques, les nanoparticules sont aussitôt « enveloppées » de protéines. Une étude menée par des chercheurs des instituts Iramis et Joliot (I2BC) précise l’importance de la taille des protéines sur la formation de cette enveloppe et recommande une meilleure prise en compte de ce paramètre dans les études protéomiques et nanotoxicologiques. Micro-nanotechnologies ; Protéomique ; Nanomédecine ; Nanotoxicologie Chercheurs ; Grand public Joliot Résultat scientifique Wed, 03 Mar 2021 11:00:00 GMT Composition du microbiote d’animaux in natura : un défi relevé par la spectrométrie de masse. https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Composition-microbiote-animaux-in-natura-spectro-masse.aspx Une équipe du SPI à Marcoule, en collaboration avec l’INRAE, a caractérisé le microbiote intestinal d’un petit crustacé utilisé comme sentinelle de la qualité des eaux en France, en combinant des approches de protéogénomique et de métaprotéomique, ouvrant ainsi d’intéressantes perspectives pour l’analyse des interactions hôte/microbiote chez d’autres modèles animaux. Spectrométrie de masse ; Bactéries ; Génomique ; Protéomique Marcoule Résultat scientifique Mon, 24 Aug 2020 10:00:00 GMT Lamines et Progéria : que nous apprend la biologie structurale ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Lamines-Progeria-biologie-structurale.aspx Une équipe de l’I2BC publie dans FEBS Journal une revue exhaustive des différentes mutations affectant la structure des lamines de type A, protéines constitutives de l’enveloppe du noyau des cellules (lamina nucléaire), qui conduisent à un vieillissement prématuré des personnes atteintes (Progéria). Biologie structurale ; Maladies SB2SM Actualité ; Article Mon, 24 Aug 2020 10:00:00 GMT Banque Venomics : découverte de deux toxines régulant l’activité de récepteurs aux mélanocortines https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Venomics-2-toxines-MC4R.aspx Dans un article publié dans le Journal of Medicinal Chemistry, le consortium Venomics mené par une équipe du SIMoS montre l’intérêt de créer des banques de toxines pour identifier des molécules régulant des cibles thérapeutiques. Criblage haut débit ; Protéomique ; Transcriptomique SIMOPRO Résultat scientifique Thu, 23 Jul 2020 10:00:00 GMT Bactéries et archées : une nouvelle taxonomie pour mieux décrire les inconnues ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Nouvelle-taxonomie-bacteries-archees.aspx ​La découverte de myriades de nouvelles espèces de bactéries et archées, liée à l’explosion de la métagénomique, amène les microbiologistes à envisager de repenser la façon de cartographier certaines branches du vivant. Des outils, comme la phylopeptidomique conçue au Li2D, pourraient les y aider. Spectrométrie de masse ; Bactéries ; Protéomique Chercheurs SPI Article Mon, 20 Jul 2020 10:00:00 GMT Analyse protéomique de cellules infectées par le virus SARS-CoV-2 https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Analyse-proteomique-cellules-infectees-SARS-CoV-2.aspx Afin d’optimiser l’amplification de virus inactivé de qualité, en vue de la fabrication d’un vaccin, une équipe du SPI à Marcoule a utilisé la spectrométrie de masse pour analyser la dynamique du protéome de cellules infectées par le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, à deux multiplicités d’infection. Avec plus de 3220 protéines de l’hôte identifiées, les chercheurs commencent également à décrypter les processus et réseaux cellulaires impactés par ce virus. Virus ; Spectrométrie de masse ; Protéomique Résultat scientifique Mon, 06 Jul 2020 10:00:00 GMT La traque aux peptides signatures de SARS-CoV-2 est lancée ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Proteomique-peptides-signatures-SARS-CoV-2.aspx Des chercheurs du SPI (Marcoule) ont utilisé la protéomique pour identifier des peptides signatures du virus SARS-CoV-2 exprimés in vitro. Une « short list » de 14 peptides identifiés et caractérisés permet d’envisager des développements en spectrométrie de masse ciblée, faisant de cette approche à grande échelle directe et rapide, implantable en milieu hospitalier, un potentiel outil de choix dans la détection du virus responsable de la Covid-19. Protéomique ; Virus ; Spectrométrie de masse Résultat scientifique Fri, 05 Jun 2020 10:00:00 GMT Focus sur la plateforme Expression de protéines membranaires en levure https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2020/Focus-plateforme-Expression-Prot-Membranaire.aspx L'Université Paris-Saclay fait un focus sur la plateforme Expression de protéines solubles ou membranaires en levure. Biologie structurale ; Mécanismes moléculaires SB2SM Focus ; Plateforme & installation ; prévisualisation levure;ATPase-P4;cryo-microscopie; Tue, 02 Jun 2020 10:00:00 GMT Focus sur la plateforme de spectroscopie RMN de l’I2BC/SB2SM https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2020/Focus-plateforme-spectroscopie-RMN.aspx Le 04 mai, le département "sciences de la vie" de l’Université Paris-Saclay a publié sur son compte Scoop.it un focus sur la plateforme de spectroscopie RMN de l’I2BC/SB2SM, spécialisée dans l’étude des caractéristiques structurales et dynamiques des systèmes biomoléculaires et particulièrement bien adaptée à l’analyse à l’échelle atomique des états fonctionnels multiples. Biologie structurale ; Cancer Focus ; prévisualisation ; Plateforme & installation Tue, 05 May 2020 10:00:00 GMT Phylopeptidomique : un nouvel outil d’analyse des microbiotes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Phylopeptidomique-analyse-microbiotes.aspx ​Des chercheurs du LI2D (Marcoule) ont développé une méthode mathématique pour identifier la contribution de chacun des organismes qui composent un microbiote dans un jeu de données de métaprotéomique. Cette méthode, la phylopeptidomique, est décrite dans le journal Microbiome. Protéomique ; Biodiversité SPI Résultat scientifique Microbiologie; Mon, 06 Apr 2020 10:00:00 GMT Une conception rationnelle de peptides aux propriétés antitumorales https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/Conception-rationnelle-peptides-inhibiteurs-Asf1-H3-H4.aspx En combinant des études structurales, informatiques et biochimiques, une équipe du SB2SM (CEA-Joliot/I2BC) a conçu des peptides inhibiteurs d’un chaperon d’histones (ASF1) aux effets potentiellement anti-tumoraux. Leur étude, en collaboration avec des équipes du SBIGEM (CEA-Joliot/I2BC) et de l’Institut Curie, ouvre des perspectives originales dans la recherche de nouvelles thérapies anticancéreuses. Mécanismes moléculaires ; Biologie structurale Chercheurs SBIGEM Résultat scientifique Mon, 02 Dec 2019 11:00:00 GMT Fièvre de Lassa : un vaccin bientôt à l’essai https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/Fievre-Lassa-vaccin-bientot-en-essai.aspx Des chercheurs de l’institut Pasteur, en collaboration avec sept équipes de recherche, dont le SPI (LI2D/Marcoule), ont développé et évalué l’efficacité de plusieurs candidats-vaccins contre le virus responsable de la fièvre hémorragique Lassa, endémique en Afrique de l’Ouest. Ils ont identifié l’un d’eux comme étant le plus efficace, susceptible d’entrer rapidement en phase d’essais cliniques chez l’Homme. Les résultats sont publiés dans le journal Science Translational Medicine. Vaccin ; Protéomique ; Virus Résultat scientifique Wed, 09 Oct 2019 10:00:00 GMT Transport transmembranaire de lipides : premières structures de flippases dévoilées ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/Drs2-Cdc50-Cryo-EM-Structure.aspx ​​Des chercheurs de l’I2BC@Saclay, de l’Université d’Aarhus et de l’Institut Max Planck à Francfort dévoilent les premières structures obtenues par cryo-microscopie électronique de l’un des membres de la famille des ATPases de type P4. Les travaux publiés dans Nature éclairent le mécanisme de régulation de ces protéines membranaires et permettent de proposer une voie de passage en leur sein pour les lipides qu’elles transportent. Biologie structurale ; Mécanismes moléculaires Saclay Communiqué de presse asymétrie lipidique;ATPase-P4;transport de lipide; Thu, 27 Jun 2019 10:00:00 GMT FRISBI : la plateforme de biologie structurale de Genopole rejoint l'infrastructure nationale https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2019/Plateforme-biologie-structurale-de-Genopole-rejoint-FRISBI.aspx ​L'Infrastructure Nationale en Biologie et Santé FRISBI (French Infrastructure for Integrated Structural Biology) intègre désormais la plateforme de biologie structurale de Genopole dans son nœud Paris-Sud. Biologie structurale Chercheurs Saclay Partenariat académique biologie structurale intégrée;microscope à force atomique;plateforme; Fri, 10 May 2019 10:00:00 GMT Réparation des cassures d’ADN : zoom sur les premières étapes. https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/reparation-ADN-premieres-etapes.aspx Une équipe du SB2SM (I2BC@Saclay), en collaboration avec le CNRS, l’Inserm, l’institut Gustave Roussy et les universités Paris-Sud et Aix-Marseille, a résolu par cristallographie la structure de deux complexes protéiques, impliqués dans la réparation des cassures d’ADN radio-induites. Des mutations ciblant les interactions identifiées dans cette étude induisent une augmentation de la radiosensibilité des cellules, un résultat prometteur à long-terme pour la radiothérapie des cancers radiorésistants. ADN ; Radiobiologie ; Radiothérapie ; Cancer ; Biologie structurale Résultat scientifique Mon, 08 Oct 2018 10:00:00 GMT Radiothérapie : Pour défendre l’ADN, les protéines partent en quête de l’anneau https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/radiotherapie-adn-proteine-ku.aspx Une équipe internationale de chercheurs a recouru à la cristallographie pour « photographier » les premiers instants du ballet moléculaire permettant à certaines cellules tumorales de réparer leur ADN après un traitement par radiothérapie. Biologie structurale ; Mécanismes moléculaires ; Diagnostic et thérapies innovantes Journalistes ; Chercheurs DRF Communiqué de presse ; Résultat scientifique cellule;radiothérapie;cristallographie;ku;Paris-Saclay;protéine;Joliot;Cancer; Fri, 05 Oct 2018 15:00:00 GMT Quelle relation entre variants du gène BRCA1 et prédisposition au cancer ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/relation-variants-BRCA1-cancer.aspx ​Des équipes de l’institut Curie, de l’institut Gustave Roussy, ainsi que des équipes de biophysique de l’institut de chimie des substances naturelles et du SB2SM (I2BC@Saclay) se sont réunies pour identifier de manière systématique les défauts structuraux et fonctionnels des protéines BRCA1 codées par des variants du gène BRCA1, un gène prédisposant au cancer du sein et de l'ovaire. Leurs résultats permettent de proposer une classification de ces variants (neutres versus causaux). Cancer ; Biologie structurale ; ADN Résultat scientifique Fri, 28 Sep 2018 10:00:00 GMT Une nouvelle interface protéique mutée dans des syndromes de vieillissement prématuré https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/nouvelle-interface-proteique.aspx ​Une équipe du SB2SM (I2BC@Saclay) a résolu par cristallographie la structure d'un complexe protéique ternaire, à l'interface entre l'enveloppe nucléaire (émerine et lamine A/C) et le génome (BAF). En collaboration avec des équipes des universités Paris-Sud et Paris-Diderot, l'analyse de cette structure ainsi que des expériences d'interaction in vitro et de proximité in cellulo, suggèrent qu'un défaut d'interaction entre la lamine A/C (nucléosquelette) et une protéine associée à la chromatine (BAF) pourrait constituer l'un des mécanismes responsables des syndromes de vieillissement prématuré. Protéomique Résultat scientifique Thu, 20 Sep 2018 10:00:00 GMT Un serveur pour prédire la structure de complexes protéiques, basé sur des données de coévolution https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/serveur-predire-structure-complexes-proteiques.aspx ​Une équipe de l'I2BC@Saclay (SB2SM), en collaboration avec la plateforme RPBS, a mis en ligne un serveur de prédiction structurale des interactions entre protéines. Ce serveur, conçu pour les biologistes, utilise l'information fournie par la coévolution des séquences protéiques et prédit la structure de complexes protéiques, une information essentielle pour la compréhension de leur rôle fonctionnel. Protéomique ; Informatique Résultat scientifique Thu, 07 Jun 2018 10:00:00 GMT Importance des modifications chimiques des protéines pour leurs interactions avec les nanoparticules https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/modifications-proteines-nanoparticules.aspx Deux équipes de l’I2BC@Saclay et du SPI (LI2D, Marcoule), en collaboration avec l’IRAMIS, mettent en évidence l’affinité très forte de nanoparticules de silice pour des protéines à motifs RGG (famille de protéines de liaison de l’ARN), particulièrement lorsque celles-ci sont méthylées. Ces résultats sont importants pour le développement d’approches « safe by design ». Nanotoxicologie ; Nanomatériaux ; Protéomique Résultat scientifique Thu, 24 May 2018 10:00:00 GMT Les fantômes de la fluorescence https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/les-fantomes-de-la-fluorescence.aspx ​La biologie cellulaire fait appel au marquage fluorescent, une technique incontournable pour suivre la vie de la cellule. Mais les protéines fluorescentes ont leurs limites, que les chercheurs de l'IBS et de l'I2BC@Saclay (SB2SM) essaient de repousser. Biologie structurale ; Protéomique Résultat scientifique Wed, 28 Mar 2018 10:00:00 GMT Une approche biotechnologique originale pour créer de nouvelles molécules bioactives https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/approche-biotechnologique-nouvelles-molecules-bioactives.aspx ​L'équipe de Muriel Gondry (I2BC@Saclay/SBIGeM), en collaboration avec le SIMOPRO et une équipe du Laboratoire des Biomolécules de Sorbonne Université, a produit par voie biologique 200 cyclodipeptides contenant des acides aminés non naturels, en leurrant puis détournant la machinerie cellulaire de synthèse des protéines. Cette approche inédite permet d'augmenter considérablement la diversité de ces molécules bioactives. Biotechnologies ; Biologie structurale Résultat scientifique Mon, 05 Mar 2018 11:00:00 GMT L’interactome protéique des nanoparticules et son rôle dans leur impact cellulaire https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/Interactome_proteique_des_nanoparticules-.aspx ​Deux équipes de recherche animées par Odette Prat (BIAM) et Jean Armengaud (LI2D, Marcoule) se sont associées dans le cadre d'un financement ANR afin de faire progresser les connaissances sur l'importance de la nature des couronnes protéiques sur l'impact cellulaire des nanoparticules. Protéomique ; Nanosciences Résultat scientifique Fri, 20 Oct 2017 10:00:00 GMT Nouveau MOOC sur la cristallographie biologique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_institutionnelles/2017/mooc_le_du.aspx ​L'Université Paris-Saclay a le plaisir de vous présenter le MOOC «Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie», fruit d'une étroite collaboration entre le CEA, le synchrotron Soleil, l'Ecole polytechnique, le CNRS, et l'université Paris Sud. Institutionnel ; Biologie structurale Actualité Mon, 18 Sep 2017 10:00:00 GMT Mesure in vivo de distances intramoléculaires protéiques par RPE pulsée. https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2016/Mesure_in_vivo_distances_intramoleculaires.aspx Une équipe du SB2SM, en collaboration avec le groupe du Professeur Rasia, de l’université de Rosario en Argentine, montre pour la première fois comment produire de manière biosynthétique des protéines porteuses d’un marqueur de spin et déterminer la distance intramoléculaire entre deux marqueurs à l'intérieur de cellules d’E. Coli intactes. Biologie structurale Résultat scientifique Thu, 08 Dec 2016 11:00:00 GMT Une diversité moléculaire insoupçonnée chez une espèce dite «non-modèle»! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2016/diversite_insoupconnee_crustace.aspx Une équipe du SPI/Marcoule, en collaboration avec le laboratoire d’écotoxicologie de l’Irstea de Lyon-Villeurbanne, a réalisé une analyse à très large échelle de la cinétique de plusieurs milliers de protéines d’un crustacé qui révèle une diversité insoupçonnée de vitellogénines, ces protéines de réserve servant de matériaux de construction lors des premiers stades de la vie. Toxicologie ; Protéomique Résultat scientifique Wed, 30 Nov 2016 11:00:00 GMT Pour l’environnement, la « protéomique 3.0 » relève le défi de la complexité ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2016/proteomique_3_defi_complexite.aspx Cette monographie proposée par Jean Armengaud (LI2D, Marcoule), spécialiste international en protéogénomique, décrit les possibilités décuplées de la protéomique nouvelle génération basée sur l’utilisation d’analyseurs orbitrap à ultra-haut-champ et de l’approche shotgun. Les champs d’innovations de la prochaine décennie seront notamment ceux où la diversité moléculaire est la plus élevée : population hétérogène d’organismes non-modèles, microbiote intestinal ou environnemental, et écosystèmes complexes. Protéomique Résultat scientifique Tue, 28 Jun 2016 10:00:00 GMT Le mécanisme catalytique des synthases de cyclodipeptides enfin élucidé ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/ARCHIVES/IBITECS/Actualites/En_ce_moment_a_IBITECS/Actualites/2015/synthases-de-cyclodipeptides-.aspx Des équipes de l’IBITECS et de l’Ecole Polytechnique (Palaiseau) ont déchiffré le mécanisme emprunté par les synthases de cyclodipeptides (CDPS) pour catalyser la formation de liaisons peptidiques. Mécanismes cellulaires ; Biologie structurale Actualité Mon, 05 Jan 2015 09:00:00 GMT Zoom sur le bout des chromosomes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/ARCHIVES/IBITECS/Actualites/En_ce_moment_a_IBITECS/Actualites/2013/Zoom-sur-le-bout-des-chromosomes.aspx Les extrémités des chromosomes, les télomères, jouent un rôle dans le vieillissement des cellules et la cancérogenèse. Une équipe du CEA-IBITEC-S se penche sur les relations entre leur structure et leurs fonctions. ADN ; Biologie structurale IBITECS Résultat scientifique Thu, 26 Sep 2013 10:00:00 GMT Syndrome de Lynch : la biologie structurale en soutien de l’aide au diagnostic https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/ARCHIVES/IBITECS/Actualites/En_ce_moment_a_IBITECS/Actualites/2013/Syndrome-de-Lynch--la-biologie-structurale-en-soutien-de-l’aide-au-diagnostic.aspx Des chercheurs du CEA-IBITECS, du CNRS et de l’Université Paris-Sud présentent le premier modèle de l’architecture de l’une des protéines impliquées dans le syndrome de Lynch, une prédisposition génétique au cancer colorectal. Biologie structurale ; Cancer IBITECS Résultat scientifique Mon, 25 Feb 2013 11:00:00 GMT Vers un inhibiteur puissant de la toxine botulique de type A? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/ARCHIVES/IBITECS/Actualites/En_ce_moment_a_IBITECS/Actualites/2013/Vers-un-inhibiteur-puissant-de-la-toxine-botulique-de-type-A-.aspx Des chercheurs du CEA-IBITECS ouvrent la voie au développement d’inhibiteurs puissants de la toxine botulique de type A, la plus dangereuse des toxines bactériennes. Biologie structurale ; Risques NRBC-E ; Diagnostic et thérapies innovantes ; Maladies infectieuses IBITECS Résultat scientifique Tue, 22 Jan 2013 11:00:00 GMT