Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot - Sur le même thème https://joliot.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/modifications-proteines-nanoparticules.aspx Site web de l'Institut des sciences du vivant Frédéric-Joliot qui comprend 4 départements : l'I2BC, le DMTS, NeuroSpin et le Service hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ). Les équipes sont localisées principalement sur le centre CEA Paris-Saclay et à l'hôpital d'Orsay. fr-FR https://www.cea.fr/Style%20Library/Themes/drf/instituts/images/logo-cea-joliot-2023.png Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot - Sur le même thème https://joliot.cea.fr/drf/joliot Décryptage des microbiotes : l’identification d’isolats microbiens fortement accélérée par protéotypage multiplex https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Identification-isolats-microbiens-par-proteotypage-multiplex.aspx Des chercheurs du SPI proposent une méthode innovante de multiplexage pour l’identification rapide de plusieurs isolats microbiens en une seule analyse de spectrométrie de masse. Une approche qui ouvre des perspectives d’identification à grande échelle des microorganismes issus de programmes de culturomique. Biologie à grande échelle ; Méthodologies pour les sciences du vivant ; Protéomique ; Bactéries SPI Résultat scientifique Fri, 24 Nov 2023 11:00:00 GMT Déficit en transporteur de la créatine : utilisation de deux modèles originaux pour cerner cette maladie génétique rare https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Proteines-impliquees-pathogenese-deficit-transporteur-creatine.aspx Des chercheurs du SPI/DMTS ont identifié par spectrométrie de masse des biomarqueurs liés au trouble du déficit en transporteur de la créatine (CTD) en utilisant 2 modèles originaux: des souris présentant les caractéristiques cliniques de sujets atteints de CTD et des organoïdes cérébraux dérivés de cellules de patients-CTD Spectrométrie de masse ; Maladies génétiques ; Biomarqueurs ; Protéomique SPI Résultat scientifique Thu, 22 Jun 2023 10:00:00 GMT Peut-on conditionner les protéines dans du plastique ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/biotherapies-peut-on-conditionner-les-proteines-dans-du-plastique.aspx Selon une étude menée par les instituts Iramis et Joliot avec leurs partenaires, des protéines en solution peuvent être déstabilisées au contact des parois d'un flacon en plastique, puis former des agrégats protéiques dégradés. Un point d'attention pour le conditionnement des protéines thérapeutiques. Diagnostic et thérapies innovantes ; Mécanismes moléculaires ; Protéomique Chercheurs ; Grand public ; Journalistes Joliot Découvertes et avancées ; Résultat scientifique Wed, 22 Mar 2023 11:00:00 GMT Identification rapide et à grande échelle du microbiote pulmonaire de la mucoviscidose par métaprotéomique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Identification-microbiote-pulmonaire-mucoviscidose-metaproteomique.aspx Une équipe du Li2D a utilisé la spectrométrie de masse en tandem pour identifier les micro-organismes présents dans des échantillons d’expectoration de patients atteints de mucoviscidose. Une approche prometteuse de protéotypage qui apporte une vue élargie et non biaisée du microbiote et pourrait être complémentaire de la surveillance microbiologique des patients. Biologie à grande échelle ; Méthodologies pour les sciences du vivant ; Protéomique SPI Résultat scientifique Tue, 14 Feb 2023 11:00:00 GMT D’une toxine marine à un antagoniste du récepteur de la mélanocortine, cible thérapeutique des troubles du métabolisme énergétique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Toxine-cone-marin-antagoniste-recepteur-melanocortine.aspx Une équipe du SIMoS découvre, dans le venin d’un cône marin, une toxine qu’elle dérive par ingénierie en un peptide antagoniste à forte affinité pour le récepteur de la mélanocortine, régulateur majeur de l’homéostasie énergétique. Un pas vers le développement de traitements inédits de certains troubles de l’alimentation. Santé & sciences du vivant ; Pharmacologie ; Criblage haut débit ; Protéomique ; Transcriptomique SIMOPRO Résultat scientifique Thu, 09 Feb 2023 11:00:00 GMT Le LI2D et la startup Phylogene s’associent pour améliorer l’analyse des microbiotes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/LI2D-Phylogene-DeepMicro.aspx Le LI2D s’est récemment associé à la société Phylogene (Nîmes), au travers du projet DeepMicro qui vise à développer de nouvelles techniques d’analyses, plus puissantes. L’acquisition d’un spectromètre de masse à très haute résolution, grâce au soutien financier de la Région Occitanie, constitue une étape décisive dans la mise en œuvre du projet. Le CEA et Phylogene ont publié un communiqué de presse le 10 mai. Protéomique Entreprises ; Institutionnels ; Journalistes ; Grand public Marcoule Communiqué de presse spectrométrie de masse;microbiome; Fri, 13 May 2022 10:00:00 GMT Un possible lien entre des modifications du microbiote intestinal et la charge fécale en SARS-CoV-2 ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Lien-microbiote-intestinal-Covid-19.aspx Une équipe du SPI (DMTS, Marcoule) a utilisé la spectrométrie de masse pour analyser le degré d’altération du microbiote intestinal de patients Covid-19 et pour rechercher des signatures de l’infection intestinale par le virus SARS-CoV-2. La dysbiose observée chez ces patients pourrait être un indicateur du stade et de l'importance de l'infection. Spectrométrie de masse ; Protéomique ; Biomarqueurs ; Maladies infectieuses SPI Résultat scientifique ; Article Thu, 12 May 2022 10:00:00 GMT La métaprotéomique et la science des données pour un diagnostic d’éco-santé du microbiote des sols https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Metaproteomique-science-donnees-microbiote-sols.aspx Des chercheurs du Li2D (SPI/DMTS, Marcoule) et du LSCE ont développé une méthodologie innovante d’analyse du microbiote des sols reposant sur une interprétation informatique optimale des bases de données de métaprotéomique qui devrait notamment permettre de mieux comprendre l’impact des polluants sur la qualité des sols et de prédire leur potentiel de restauration. Environnement ; Protéomique ; Spectrométrie de masse ; Bactéries LSCE Résultat scientifique Thu, 07 Oct 2021 10:00:00 GMT Couronne protéique autour des nanoparticules : une affaire de taille ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/couronne-proteique-autour-des-nanoparticules--une-affaire-de-taille-.aspx Plongées dans des milieux biologiques, les nanoparticules sont aussitôt « enveloppées » de protéines. Une étude menée par des chercheurs des instituts Iramis et Joliot (I2BC) précise l’importance de la taille des protéines sur la formation de cette enveloppe et recommande une meilleure prise en compte de ce paramètre dans les études protéomiques et nanotoxicologiques. Micro-nanotechnologies ; Protéomique ; Nanomédecine ; Nanotoxicologie Chercheurs ; Grand public Joliot Résultat scientifique Wed, 03 Mar 2021 11:00:00 GMT Composition du microbiote d’animaux in natura : un défi relevé par la spectrométrie de masse. https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Composition-microbiote-animaux-in-natura-spectro-masse.aspx Une équipe du SPI à Marcoule, en collaboration avec l’INRAE, a caractérisé le microbiote intestinal d’un petit crustacé utilisé comme sentinelle de la qualité des eaux en France, en combinant des approches de protéogénomique et de métaprotéomique, ouvrant ainsi d’intéressantes perspectives pour l’analyse des interactions hôte/microbiote chez d’autres modèles animaux. Spectrométrie de masse ; Bactéries ; Génomique ; Protéomique Marcoule Résultat scientifique Mon, 24 Aug 2020 10:00:00 GMT Banque Venomics : découverte de deux toxines régulant l’activité de récepteurs aux mélanocortines https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Venomics-2-toxines-MC4R.aspx Dans un article publié dans le Journal of Medicinal Chemistry, le consortium Venomics mené par une équipe du SIMoS montre l’intérêt de créer des banques de toxines pour identifier des molécules régulant des cibles thérapeutiques. Criblage haut débit ; Protéomique ; Transcriptomique SIMOPRO Résultat scientifique Thu, 23 Jul 2020 10:00:00 GMT Bactéries et archées : une nouvelle taxonomie pour mieux décrire les inconnues ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Nouvelle-taxonomie-bacteries-archees.aspx ​La découverte de myriades de nouvelles espèces de bactéries et archées, liée à l’explosion de la métagénomique, amène les microbiologistes à envisager de repenser la façon de cartographier certaines branches du vivant. Des outils, comme la phylopeptidomique conçue au Li2D, pourraient les y aider. Spectrométrie de masse ; Bactéries ; Protéomique Chercheurs SPI Article Mon, 20 Jul 2020 10:00:00 GMT Analyse protéomique de cellules infectées par le virus SARS-CoV-2 https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Analyse-proteomique-cellules-infectees-SARS-CoV-2.aspx Afin d’optimiser l’amplification de virus inactivé de qualité, en vue de la fabrication d’un vaccin, une équipe du SPI à Marcoule a utilisé la spectrométrie de masse pour analyser la dynamique du protéome de cellules infectées par le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, à deux multiplicités d’infection. Avec plus de 3220 protéines de l’hôte identifiées, les chercheurs commencent également à décrypter les processus et réseaux cellulaires impactés par ce virus. Virus ; Spectrométrie de masse ; Protéomique Résultat scientifique Mon, 06 Jul 2020 10:00:00 GMT La traque aux peptides signatures de SARS-CoV-2 est lancée ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Proteomique-peptides-signatures-SARS-CoV-2.aspx Des chercheurs du SPI (Marcoule) ont utilisé la protéomique pour identifier des peptides signatures du virus SARS-CoV-2 exprimés in vitro. Une « short list » de 14 peptides identifiés et caractérisés permet d’envisager des développements en spectrométrie de masse ciblée, faisant de cette approche à grande échelle directe et rapide, implantable en milieu hospitalier, un potentiel outil de choix dans la détection du virus responsable de la Covid-19. Protéomique ; Virus ; Spectrométrie de masse Résultat scientifique Fri, 05 Jun 2020 10:00:00 GMT Phylopeptidomique : un nouvel outil d’analyse des microbiotes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Phylopeptidomique-analyse-microbiotes.aspx ​Des chercheurs du LI2D (Marcoule) ont développé une méthode mathématique pour identifier la contribution de chacun des organismes qui composent un microbiote dans un jeu de données de métaprotéomique. Cette méthode, la phylopeptidomique, est décrite dans le journal Microbiome. Protéomique ; Biodiversité SPI Résultat scientifique Microbiologie; Mon, 06 Apr 2020 10:00:00 GMT Fièvre de Lassa : un vaccin bientôt à l’essai https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/Fievre-Lassa-vaccin-bientot-en-essai.aspx Des chercheurs de l’institut Pasteur, en collaboration avec sept équipes de recherche, dont le SPI (LI2D/Marcoule), ont développé et évalué l’efficacité de plusieurs candidats-vaccins contre le virus responsable de la fièvre hémorragique Lassa, endémique en Afrique de l’Ouest. Ils ont identifié l’un d’eux comme étant le plus efficace, susceptible d’entrer rapidement en phase d’essais cliniques chez l’Homme. Les résultats sont publiés dans le journal Science Translational Medicine. Vaccin ; Protéomique ; Virus Résultat scientifique Wed, 09 Oct 2019 10:00:00 GMT La couronne des protéines adsorbées sur des nanoparticules de silice dévoile sa structure https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/corona-proteines-nanoparticules-silice.aspx Des chercheurs de l’I2BC@Saclay et de l’Iramis, en collaboration avec le laboratoire Léon Brillouin, ont analysé la structure de la "corona" de deux protéines modèles adsorbées sur des nanoparticules de silice, en utilisant la technique de diffusion des neutrons aux petits angles. Ils montrent que les structures formées sont de véritables nanoassemblages, dans lesquels les protéines conservent leur forme. Nanotoxicologie Résultat scientifique Wed, 18 Sep 2019 10:00:00 GMT Une nouvelle interface protéique mutée dans des syndromes de vieillissement prématuré https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/nouvelle-interface-proteique.aspx ​Une équipe du SB2SM (I2BC@Saclay) a résolu par cristallographie la structure d'un complexe protéique ternaire, à l'interface entre l'enveloppe nucléaire (émerine et lamine A/C) et le génome (BAF). En collaboration avec des équipes des universités Paris-Sud et Paris-Diderot, l'analyse de cette structure ainsi que des expériences d'interaction in vitro et de proximité in cellulo, suggèrent qu'un défaut d'interaction entre la lamine A/C (nucléosquelette) et une protéine associée à la chromatine (BAF) pourrait constituer l'un des mécanismes responsables des syndromes de vieillissement prématuré. Protéomique Résultat scientifique Thu, 20 Sep 2018 10:00:00 GMT Un serveur pour prédire la structure de complexes protéiques, basé sur des données de coévolution https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/serveur-predire-structure-complexes-proteiques.aspx ​Une équipe de l'I2BC@Saclay (SB2SM), en collaboration avec la plateforme RPBS, a mis en ligne un serveur de prédiction structurale des interactions entre protéines. Ce serveur, conçu pour les biologistes, utilise l'information fournie par la coévolution des séquences protéiques et prédit la structure de complexes protéiques, une information essentielle pour la compréhension de leur rôle fonctionnel. Protéomique ; Informatique Résultat scientifique Thu, 07 Jun 2018 10:00:00 GMT Importance des modifications chimiques des protéines pour leurs interactions avec les nanoparticules https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/modifications-proteines-nanoparticules.aspx Deux équipes de l’I2BC@Saclay et du SPI (LI2D, Marcoule), en collaboration avec l’IRAMIS, mettent en évidence l’affinité très forte de nanoparticules de silice pour des protéines à motifs RGG (famille de protéines de liaison de l’ARN), particulièrement lorsque celles-ci sont méthylées. Ces résultats sont importants pour le développement d’approches « safe by design ». Nanotoxicologie ; Nanomatériaux ; Protéomique Résultat scientifique Thu, 24 May 2018 10:00:00 GMT Les fantômes de la fluorescence https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/les-fantomes-de-la-fluorescence.aspx ​La biologie cellulaire fait appel au marquage fluorescent, une technique incontournable pour suivre la vie de la cellule. Mais les protéines fluorescentes ont leurs limites, que les chercheurs de l'IBS et de l'I2BC@Saclay (SB2SM) essaient de repousser. Biologie structurale ; Protéomique Résultat scientifique Wed, 28 Mar 2018 10:00:00 GMT L’interactome protéique des nanoparticules et son rôle dans leur impact cellulaire https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/Interactome_proteique_des_nanoparticules-.aspx ​Deux équipes de recherche animées par Odette Prat (BIAM) et Jean Armengaud (LI2D, Marcoule) se sont associées dans le cadre d'un financement ANR afin de faire progresser les connaissances sur l'importance de la nature des couronnes protéiques sur l'impact cellulaire des nanoparticules. Protéomique ; Nanosciences Résultat scientifique Fri, 20 Oct 2017 10:00:00 GMT Les nanoparticules de silice piègent les protéines qui fixent l'ARN https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/nanoparticules_silice_proteines_ARN.aspx Une collaboration entre des chercheurs de l'IBITECS* et une équipe de l'IRAMIS montre que les protéines qui lient l'ARN s'adsorbent fortement sur les nanoparticules de silice. En particulier, les protéines impliquées dans l'initiation de la traduction sont facilement piégées par ces nanoparticules, inhibant la synthèse des protéines. Nanotoxicologie Résultat scientifique Fri, 24 Feb 2017 11:00:00 GMT Une diversité moléculaire insoupçonnée chez une espèce dite «non-modèle»! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2016/diversite_insoupconnee_crustace.aspx Une équipe du SPI/Marcoule, en collaboration avec le laboratoire d’écotoxicologie de l’Irstea de Lyon-Villeurbanne, a réalisé une analyse à très large échelle de la cinétique de plusieurs milliers de protéines d’un crustacé qui révèle une diversité insoupçonnée de vitellogénines, ces protéines de réserve servant de matériaux de construction lors des premiers stades de la vie. Toxicologie ; Protéomique Résultat scientifique Wed, 30 Nov 2016 11:00:00 GMT Pour l’environnement, la « protéomique 3.0 » relève le défi de la complexité ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2016/proteomique_3_defi_complexite.aspx Cette monographie proposée par Jean Armengaud (LI2D, Marcoule), spécialiste international en protéogénomique, décrit les possibilités décuplées de la protéomique nouvelle génération basée sur l’utilisation d’analyseurs orbitrap à ultra-haut-champ et de l’approche shotgun. Les champs d’innovations de la prochaine décennie seront notamment ceux où la diversité moléculaire est la plus élevée : population hétérogène d’organismes non-modèles, microbiote intestinal ou environnemental, et écosystèmes complexes. Protéomique Résultat scientifique Tue, 28 Jun 2016 10:00:00 GMT Nanoparticules : une méthode pour étudier les faibles doses https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/ARCHIVES/IBITECS/Actualites/En_ce_moment_a_IBITECS/Actualites/2015/Nanoparticules--une-methode-pour-etudier-les-faibles-doses.aspx Pister la bioaccumulation des nanoparticules à des doses environnementales est un vrai défi scientifique. Deux équipes du CEA Saclay (DSM-Iramis et DSV-IBITECS) sont parvenues à suivre le parcours de nanoparticules de dioxyde de titane à des doses environnementales dans des moules de rivière. Nanotoxicologie Saclay Résultat scientifique Thu, 16 Apr 2015 10:00:00 GMT